Yusuke Okazaki @yokadzaki
湖に生息する微生物の研究をしてます。 Working on aquatic microbial ecology in Japan. yusukeokazaki.weebly.com Japan Joined May 2011-
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Yusuke Okazaki retweeted
Excited that our paper on the freshwater SAR11 clade (previously known as Fonsibacter, now Fontibacterium) is now out. nature.com/articles/s4156… Great work by Clafy Fernandes - the first first-author paper of her thesis - and the whole team and collaborators. More to come soon :)
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Yusuke Okazaki retweeted
Would you like to do a PhD or Postdoc in my lab on Marine Virology and Microbiology. Accepting candidates now!!!
優秀な日本人にも進学してもらうにはどうしたら良いかを考えるべきなのに優劣関係なく国籍で切り落とすのは意味が分からなさすぎるし現場を見てなさすぎる yomiuri.co.jp/kyoiku/kyoiku/…
Now published in ISME Communications! academic.oup.com/ismecommun/adv…
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Yusuke Okazaki retweeted
研究室のZhaoさんらの論文です。dsDNAウイルスの類似配列領域を真核生物の全ての系統のゲノムデータ中に徹底的に探索しました。最大16%のゲノム領域がdsDNAウイルス類似配列の例もあり、これまでに知られていないウイルスと宿主の関係が多数浮き彫りになりました。biorxiv.org/content/10.110…
Yusuke Okazaki retweeted
特定研究員2名の公募です（2025年4月着任）。 京都大学化学研究所@宇治キャンパスで、バイオインフォマティクス研究に取り組んでいただく研究員を公募しております。研究内容について事前にご相談いただくこともできます。奮ってご応募ください！
特定研究員2名の公募です（2025年4月着任）。 京都大学化学研究所@宇治キャンパスで、バイオインフォマティクス研究に取り組んでいただく研究員を公募しております。研究内容について事前にご相談いただくこともできます。奮ってご応募ください！
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比較ゲノム解析ツール DiGAlign の紹介動画が、「統合TV」で公開されました！ 「DiGAlign を使ってゲノムの変化を可視化する」 togotv.dbcls.jp/20241022.html DiGAlignは、最大300ゲノムの大規模な比較ゲノム解析ができるWebサーバーで（無料）、簡単に使えます！ genome.jp/digalign/
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京都 宇治の萬福寺の本堂「大雄宝殿」など３棟が国宝指定へ www3.nhk.or.jp/lnews/kyoto/20…
東京→熊本→つくば→広島→武漢→琵琶湖→東京の4週間が始まった。京都にいるのは8日しかない。体調優先で乗り切る
Now published in The ISME Journal! academic.oup.com/ismej/advance-…
Now published in The ISME Journal! academic.oup.com/ismej/advance-…
Sampling Lake Aoki, a small deep lake in ski resort.
Joint sampling in Lake Biwa with people from @limnostation !
Posted a new preprint! Exploration of viral signals in SAGs of lake bacterioplankton community revealed novel virus-host pairs and the broad range of viral infection rate depending on the host's ecological strategy: biorxiv.org/content/10.110…
Yusuke Okazaki retweeted
DAY 3 of #VoM2024 Our Viral Ecology Session connects the dots between viruses, microbes, and their ecosystems. Our invited speaker Prof Debbie Lindell starts with a view into cyanophage hotspots✨ Followed by selected talks by @yogihooda88, @SarahWater10 & @yokadzaki!
Yusuke Okazaki retweeted
Our new preprint! Using two years of seawater metagenomes, we generated 1,065 giant virus genomes and found that viruses with broader niche breadth tended to have greater microdiversity. Additionally, year-round recovery patterns were observed in the viral microdiveristy.
Our new preprint! Using two years of seawater metagenomes, we generated 1,065 giant virus genomes and found that viruses with broader niche breadth tended to have greater microdiversity. Additionally, year-round recovery patterns were observed in the viral microdiveristy.
Yusuke Okazaki retweeted
新しいアーキアの「界」プロメテアーカエアティについてのブログ記事がでました。これは英語で、どちらかというと研究者向けに書いた記事になります。日本語の記事については準備中です。 microbiologysociety.org/blog/appreciat…..
Yusuke Okazaki retweeted
annualreviews.org/content/journa… The diversity of gene pools carried by different strains of bacteria is maintained due to the control exercised by viral predation that maintains a high strain diversity and facilitates the degradation of dissolved organic matter in the ocean.
Yusuke Okazaki retweeted
We traced #photosynthesis deep into the history of #Bacteria & #Earth! Vertical #evolution in Terrabacteria, a non-O2-generating origin, later rise of O2 generation and even later Cyanobacteria, & more. On PNAS w @thermo_microbes @tsuka_pennstate @PNASNews pnas.org/doi/10.1073/pn…
Lake Biwa sampling day! It is already like summer ☀
Yusuke Okazaki retweeted
A bacterium that can’t make its own cell wall without a partner!? Our new isolate from the uncultured phylum Marinimicrobia/SAR406/Marine Group A/Marinisomatota #bacteria #microbiology #ecology doi.org/10.1038/s41564…
iwasakiw @iwasakiw
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Susumu Yoshizawa @qo_opYoshizawa
3K Followers 688 Following 光を利用する微生物の研究をしています。光と色が大好きです。絵も描きます。物の色っていうのは、光のあり方で変わってくる相対的なもんです。 だから 絶対音感はあっても絶対色感は無いんだー。 けれども絶対色感を持っていると思ってる。なんとなく雰囲気的に。ムーとかススムとか呼ばれます。
Kenji Fukushima (福�... @kfuku0502
3K Followers 2K Following A researcher getting trapped by carnivorous plants
深野 祐也 @Alien_Evolve
13K Followers 1K Following 生態学/作物学＠千葉大学園芸学部。人間と生物の相互作用を広く研究しています。都市や農地に棲む生物の急速な進化、ICTと持続的な農業、進化心理と自然観などなど。「最も基礎的な学問は最も応用的である」伊藤嘉昭。SF好きです。つぶやくアイデアはCC0です。『世界は進化に満ちている』（岩波書店）を書きました。
Maliheh Mehrshad @mehrshmali
1K Followers 2K Following Multipartite parasitic interactions in the microbial world, Phage co-infection studies (MULTIPHAGE) #ERC_StG, #curiosity_driven, #microbiology_without_borders
Shunsuke Matsuoka @Mtok_Snsk
806 Followers 161 Following Ecologist。生態学、菌類、生物多様性、群集、メタバーコーディング、環境DNA、な研究をしながら、きのこの勉強や料理してます。構成成分はロックと金麦と変なキャラクター。特別はネクライとUSG。趣味のみのインスタmtok_snpk
Haruka Ozaki (尾崎�... @yuifu
4K Followers 3K Following Computational biology/Bioinformatics/Research automation. PhD. Tweet in Japanese. 理研と筑波大でバイオインフォと研究自動化のラボを主宰 Lab at RIKEN & Univ. Tsukuba: @ozakilab
Curtis Suttle @Virosphere2012
2K Followers 532 Following Purveyor of the https://t.co/iKDI174lmH Prof Earth, Ocean & Atmospheric Sciences, Microbiology & Immunology, Botany, and the Inst for the Oceans & Fisheries
windowmoon＠𝕏 @windowmoon
2K Followers 584 Following JK of evolutionary community ecology. Love fishing, cycling, tea tasting, and all living things. Unfollow is free and your right. CC-BY.
Tominaga K. (tomiken) @pacyc1841
844 Followers 173 Following Decoding and interpreting genomes of marine microbes and viruses — from molecular function to planetary ecosystems
Masahito Hosokawa @mahosokawa
908 Followers 506 Following 細川正人, Assoc Prof @Waseda_univ Founder/CSO @bit_Biome https://t.co/bzA8qj6hWM single-cell genomics, microfluidics, microbiome, bitBiome(株)創業者CSO, 早稲田大学 准教授
Naoki Konno @utnk1
1K Followers 2K Following Ph.D., Evolutionary biologist, @UTokyo_Science→@Stanford, @EvoDevo_wakate, @gakuhen_phycoB, #bioinformatics, #PredictingEvolution, Single-cell omics, tk64
Yu Nakajima @nkjmu
2K Followers 1K Following 京都生まれ. 膳所→九大水産→東大AORI→産総研(学振PD)→JAMSTEC(MRU CeBN, 特任研究員). 博士(環境学) Ph.D. 興味: 宇宙, 数学, 微生物生態, 分類, 科学コミュニケーション. https://t.co/M3ISzQvwuN
tani @tani13110426
2K Followers 674 Following 一応、歯科医師。次世代シークエンス、メタゲノム解析に取り組んでいます。NovaSeq、T7、DNBSEQ、MiSeqとナノポア(GridIONと PromethION)の6台体制。高精度な細菌全ゲノムシーケンスにも力を入れています。 受託解析業務は新設したゲノムリード株式会社へと移行します。
M.Ushio @ong8181
925 Followers 138 Following An ecologist at HKUST in Hong Kong. Ecosystem ecology, environmental DNA, statistics, and many others | 香港科技大学、生態系動態、環境DNA、統計解析 | 野外の生態系動態を理解したい
The Sato Lab (Kei Sat... @SystemsVirology
20K Followers 2K Following 東京大学医科学研究所システムウイルス学分野教授🇯🇵 Duke-NUS🇸🇬、他🇯🇵🏴🇹🇭で客員教授 The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium主宰 週プレNEWSでコラム連載中→https://t.co/zLvSNcurTq
まつこ💉💉💉... @ma31stm
2K Followers 6K Following 雑草魂weed spirit。人生、あふれる伸びしろ。(ò_ó) おはぎ(サビ猫♀)との暮らしも8年。絶賛プンスカ祭り開催中の中学生の親。日日是好日。猫神様のご加護の下、猫様にも人間にも幸あれ✨
Chris Greening @greeninglab
8K Followers 4K Following Professor & NHMRC Fellow at @MonashUni's Dept of Microbiology. Using microbes to tackle global challenges in health and sustainability. #FirstGen 🐶🇦🇺🌈🎹🌱
ckj @savage01elite
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thatarchbald @thatarchbald
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katsuma @simaru07
41 Followers 248 Following 大学院修士課程2年の学生です✨ 生化学研究室で酵素の活性測定を主にしています☺️ 現在は酵素活性の測定法の改良に挑んでいます💪 趣味はマンガで、最近はフラジャイル、ぐらんぶるを読んでいます🏖️
alox @alox56541955
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H Tomita @tommy_bio_osaka
317 Followers 199 Following 阪大・分子微生物学研究室・准教授。京大卒→東大PD→北大助教→現職。 微生物の一次、二次代謝の基礎研究。アカデミアのあれこれをつぶやきます。娘2人のパパ。2025.1〜再開
Qoo @Qoo59870147
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Michael Angelou Nada @mikerobiome02
348 Followers 882 Following Swiftie| MSc student| Research associate - Marine microbial #symbiosis OceanAcidification @up_msi; #phages Omics. #StandwithFarmers #pawrent🐕
Deeeval @Deeeval2866
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ぼ @bokkuzu
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Midori Akiyama @midoriakiyamaF
2K Followers 657 Following Assistant Prof. at KyotoU. Organic chemistry, Fluorine, and Beer. 京都大学大学院分子工学専攻 今堀研究室 助教の秋山みどりです。研究活動と京都の美味しいもの(主にビールとそれに付随するもの)を紹介しています。
ASUQ @asuq4096
655 Followers 888 Following @sangerinstitute CellGenIT | Bioinformatician / Microbiologist | @OISTedu SC23 & ECBSU RI | 九大生物 | ガチファイ3期 | ツイートしてない時、だいたいラボにいます
Atsushi Usami @AtsushiUsami_VC
414 Followers 233 Following Partner and Board Director at UTEC - The University of Tokyo Edge Capital Partners @UTEC_official
Arisa Nishihara @ArisaNish
600 Followers 488 Following A postdoc working on microbiology in hot springs and evolutionary history of nitrogen fixation and photosynthesis🦠
Yifan ZHOU @yifanZHOU96
105 Followers 251 Following PhD student at Institut Pasteur | Archaeal Virology | metagenomics/metaviromics | AOA | Haloarchaea
Moin Sheam @Moin_Sheam
82 Followers 347 Following PhD student at @unccharlotte / Studying giant viruses/ Marine microbial ecologist /M.Sc. @imbrsea, @ugent, @sorbonne_university
Rachele Gore #SmallTh... @Guts_and_Gore
254 Followers 581 Following Microbiome explorer. Humanist, ND Scientist, Mum. On unceded Woiwurrung lands. Alt platform: @[email protected]; https://t.co/pnAMuideO2
清家 泰介 | SEIKE... @Sp_2106
654 Followers 370 Following 九工大・准教授 (PI), JSTさきがけ, JST GteX, 理研・客員研究員, 遺伝研・外来研究員 (←学振DC1, 学振PD, 理研SPDR, JST ACT-X) 酵母の有性生殖の進化と野生酵母の生態に興味があります。ショウジョウバエなどから酵母を単離するプロジェクトを進行中。ENFP。
Megha Kaviraj, Ph.D.�... @kaviraj_megha
479 Followers 2K Following UK-India Fellow | Microbes🦠 | Soil | Biogeochem cycles | GHGs | Isotope | Omics 🧬 | @UoB_official @RiceIcar @UniBirmingham @iiserkol @CSIR_IMTECH📍🇮🇳 🇬🇧
Takuya Nakamura @TN_microbe
3 Followers 43 Following 微生物を専門とする大学院生/ Keywords: microbes, marine science, phytoplankton, bacteria, virus, omics analysis, bioinformatics
狩野清志郎 @8X6RACfjUEdeFAa
1 Followers 97 Following
Genki Yumoto @GenkiYumoto
151 Followers 300 Following Shinshu Univ., Kyoto Univ., CER, JIC., Project assistant prof., Plant molecular ecology
山本とうや（Toy... @toyayamamoto123
552 Followers 2K Following PhD student/plant pathology@UTokyo 徳島市立 53期→徳大 生資→東大院農D3 植物病理、SPRING、DC2、ELCAS8th、エコ甲9th、57th～63rd生化夏学、ゆず、アイドル、将棋、書道
Pengfei Liu @liupfskygre
160 Followers 369 Following Center for Pan-third Pole Environment, Lanzhou University, +86 postdoc@CSU, @TheWrightonLab 2019; @MPI Marburg with Ralf Conrad and Andreas Brune 2015-2019
Javier E. Fernandez @... @JaviF_86
984 Followers 4K Following 🧬🦠 AMR/Microbial Genomics/Bioinformatics. Tracking AMR bacteria from a One-Health perspective. Passionate ➡️ phylogenomics, plasmids and phages. 🇦🇷 in 🇨🇭
Ricardo I. Alcalá @ricardoI_
1K Followers 3K Following Agricultural systems and natural ecosystems: viromes, microbiomes, ecology | hanging in limbo
Selfpity @Selfpity190230
50 Followers 3K Following
Noya @Noya82866669340
93 Followers 2K Following
Laughaway @Laughaway34336
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Shinichi NISHIMURA @shinichi246
174 Followers 274 Following 西村 慎一 Natural product chemist, microbiologist, Professor@Hiroshima University. Lab website: https://t.co/mJccqMsGAo 広島大学 生物生産学部 海洋生物資源化学研究室.
MirandaConnor @MQr11102g98fzbs
132 Followers 3K Following 生活は他の場所にはなく、今がすべてです。好きな状態の中で、生活の日はキラキラしていて、一度だけの命は本当の気性で生きる必要があり、人生のすべての段階で自分を大切にしなければなりません。
vpreyes @vpreyes1
92 Followers 361 Following Molecular Breeding. Plant Genetics. Agri Genomics. Postdoc Fellow @NagoyaUniv. Views are mine.
Hirono Suzuki @HironoSuzukiX
72 Followers 242 Following a snow algae enthusiast ❄️☃️🔴☄️now living in France working on CCM. 北極圏で氷雪微細藻類の研究をしながら、現在は南フランスで微細藻類二酸化炭素濃縮システムの研究をポスドクとして研究中。Protist/algae/CCM
Liwen Zhang @Liwen_Zhang_
18 Followers 106 Following PhD student @KyotoU | Studying the diversity of freshwater giant viruses | Interested in #Microbiology #viruses #Evo&Eco
Masato Yamamichi | �... @MasatoYamamichi
773 Followers 698 Following Associate Professor at the National Institute of Genetics @NIG_idenken / SOKENDAI @SokendaiU / UTokyo @UTokyo_Agri
みんみん/Osawa Mi... @misuzubone289
451 Followers 2K Following SU Environmental Science M1/ Astrobiology Club / 海の女性ネットワーク/ Biogeochemistry
RoBox @RoBoxMaGnetron
691 Followers 738 Following 総研大/極地研D1(後)❄️, メロンパンをチャージすると目からレーザーをだす!! ✦分子微生物学, 環境ｽﾄﾚｽ, 微生物生態学, 大気化学, 北極 🏔️ 🌨 🦠
Hiroaki Sugino @hiruandondemo
528 Followers 2K Following Hiroaki Sugino, an environmental psychologist, wondering around trajective dynamics of human-environment ;-) 杉野弘明の個人アカ。山口県出身。日常、環境心理学、人間環境学、言語学、心理学、犯罪学、都市計画学など。
iwasakiw @iwasakiw
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Cameron Thrash @jcamthrash
17K Followers 475 Following Professor @USC_MEB, microbe hunter. he/him. Not a bot. @[email protected] @jcamthrash.bsky.social
Susumu Yoshizawa @qo_opYoshizawa
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日本の研究.com�... @rjp_news
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Maliheh Mehrshad @mehrshmali
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高井研 @1031kentakai
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Michael Henson, Ph.D. @HensonMW_08
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Junna Kawasaki 川崎... @J_191206
674 Followers 809 Following Ph.D., DVM. Assistant Professor, Chiba University. Zoonotic viruses 🦠 ⇄ bioinformatics 🖥. "Be there anytime"
Atsushi Usami @AtsushiUsami_VC
414 Followers 233 Following Partner and Board Director at UTEC - The University of Tokyo Edge Capital Partners @UTEC_official
Zhichao Zhou @ZhichaoZhou_CHN
1K Followers 3K Following Professor at Shenzhen University, China Biogeochemistry + Viral/Microbial Omics-related Bioinformatics + Ecology + Evolution + Music
Karthik Anantharaman @KarthikGeomicro
3K Followers 796 Following Associate Professor, UW-Madison - On Sabbatical at IIT Madras. Microbial/Viral Ecology, Bioinformatics, Biogeochemistry. Find me on 🟦sky @karthik-a.bsky.social
【準公式】国宝... @manpukuji_X
14K Followers 108 Following 【萬福寺の満腹なお話】https://t.co/cxRfT645JC いんげん豆って中国から来た”隠元さん”のお土産だって知ってました？ インゲン豆、スイカ、れんこん、揚げ物… さらにダイニングテーブルに椅子 「一家だんらん」はインゲンさんが持ちこんだってワケなんだ （2000年『そうだ 京都、行こう。』より）
Masato Yamamichi | �... @MasatoYamamichi
773 Followers 698 Following Associate Professor at the National Institute of Genetics @NIG_idenken / SOKENDAI @SokendaiU / UTokyo @UTokyo_Agri
環境ウイルス研... @JSME_envirus
68 Followers 98 Following 微生物生態学会 環境ウイルス研究部会の若手が運営しています。新着論文の紹介や部会の活動のお知らせ、部会員の研究の紹介などを行う予定です!どうぞよろしくお願いします！
琵琶湖リアルタ... @biwako_info
11K Followers 0 Following 琵琶湖のリアルタイム情報を1時間毎に呟きます。 呟くのは以下の情報です。 ・琵琶湖の水温 ・洗堰の放水量 ・琵琶湖水位 前日からの変動具合が分かるグラフも設置しています。 https://t.co/Mil7KNSuwn
Risa K Kawaguchi @can_pyong
843 Followers 368 Following Assoc Prof @ UTokyo & Lecturer @ Kyoto Univ 🇯🇵 ← CSHL 🇺🇸 and AIST ← Univ. of Tokyo 𝄆 Comp Bio, Bioinfo, Stats & ML 𝄇 河口理紗 (PhD) 👶 0yr boy
World of Statistics @stats_feed
4.3M Followers 444 Following There are three kinds of lies: lies, damned lies, and statistics. Sister page of @engineers_feed
滋賀県立琵琶湖... @biwahaku
8K Followers 43 Following 「湖と人間」がテーマの、びわ湖の全てを体感し学ぶことができる何度も来たくなるミュージアムです。コメントへの返信等はおこないませんので予めご了承ください。 （利用要領・ガイドライン）https://t.co/AoWqQKHMjo
ウォーターステ... @WS_Biwa
3K Followers 275 Following ウォーターステーション琵琶は国土交通省の施設です😊流域で活動されている方を支援します🙌当館の利用は無料です（※利用条件あり）。休館日の火曜以外、日々琵琶湖の水位をつぶやきます😄皆様のご来館お待ちしています😊開館時間🕘9:00～🕔17:00
先進ゲノム支援 @PAGSgenome2
455 Followers 19 Following 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム（第2期先進ゲノム支援） 文部科学省科学研究費助成事業の学術変革領域研究『学術研究支援基盤形成』 に2022年から6年間の予定で採択されたものです。 このアカウントでは、公募情報、講習会情報などをお知らせしていきます。 ご質問等は公式サイトの『お問い合わせ』からお願い致します。
須賀川拓🇯🇵�... @HiroshiSukagawa
73K Followers 1K Following 紛争地の声を届けたい 🇵🇸🇮🇱🇱🇧🇮🇶🇮🇷🇦🇪🇹🇷🇦🇫🇺🇦etc, ボーン上田記念国際記者賞 料理,カメラ,海,山,魚,スキー,自転車etc Husband, father https://t.co/1gjCwetzbE
Ngosh @SaudiDaudi
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Takuhei Shiozaki @ShiozakiTakuhei
245 Followers 167 Following 東京大学大気海洋研究所で海洋学の研究をしています。最近はもっぱら極域の研究をしています。船ばかり乗ってます。合計乗船日数1496日。最近、極域つながりで雪山の観測も始めました。
SeqCode @seq_code
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Cecilia Chiriac @cecilia_chiriac
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Markus Haber @Spongebac
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Paul Layoun @LayounPaul
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Alan Hon Lun Wong @AlanWong0424
262 Followers 653 Following EMBO Postdoctoral Fellow studying virus-host interaction in freshwater lakes. Likes microbiology and learning new things https://t.co/VOsA6RpCd0…
Stefan Bertilsson @Stebe69
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めんだこ @mendako_vent
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琵琶湖の水産業... @BiwakoLover
10K Followers 251 Following 琵琶湖の水産業をみんなで知恵を出し合い、盛り上げていくオープンでフラットな参加型のコミュニティです。 講演依頼やメディア等の出演依頼を受け付けておりますので、気軽にメッセージください。 当該SNSのライターさんも募集中です。 現在20名ほどのライターさん在籍中。
京都大学生態学... @CER_KyotoUniv
1K Followers 10 Following 京都大学生態学研究センター公式Twitterです。センターのイベント、ニュース、研究成果、研究の様子などをお伝えします。個別のご質問にはお答えできませんのでご了承ください。なかのひとはいろいろおります。2021年1月より試験運用中です。
Tara Oceans Scientifi... @TaraOceans_Sci
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Ester Eckert @me_la_ester
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Viruses of Microbes 2... @VoM_2024
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Louie Lopez @PinoyPlankton
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ゲノムリード株... @GenomeLead
910 Followers 313 Following 旧、谷口歯科医院・口腔常在微生物叢解析センターです。法人化に伴い名前がスッキリしました。 6台の次世代シークエンサー(MiSeq、NovaSeq、DNBSEQ 、T7、ナノポアGridiON、PromethION)を使って様々なシーケンスの受託解析に取り組んでいます。完全に国内シーケンスです✨
しがトコ：滋賀... @shigatoco
30K Followers 636 Following 滋賀を自慢したくなるローカルメディア「しがトコ」“滋賀のええトコ”をテーマに、風景や新スポットなどさまざまな情報を紹介📍#しがトコ の投稿をリツイートも！琵琶湖が好き、滋賀が好き、滋賀に興味がある⚡️そんな方はぜひフォローを📷Instagram: https://t.co/F9VdOLJks4
国土交通省 琵�... @mlit_biwako_ka
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